Basic data
| Activiteitencentrum | Sint-Jan |
| Database | Moleculaire microbiologie |
| Groep | Virale DNA/RNA detectie |
| Code | 55092 |
| Verzending | Nee |
Detail data
| Lichaamsmateriaal voorkeur | Nasopharynxaspiraat - Nasopharyngeale wisser samen met keelwisser (flocked swabs) in UTM-buisje |
| Lichaamsmateriaal toegelaten | BAL, sinusaspiraat, nasal wash, neusaspiraat, opgehoest sputum |
| Recipient voorkeur | Schroefdoptube, UTM-buisje |
| Recipient toegelaten | Potje, spuitje met dop |
| Mininum vereiste volume | 1 mL |
| Analysevolume | 800 µL |
| Bewaarcondities en voorbehandeling | Indien snel transport naar het labo niet mogelijk is, dienen de monsters bij 4°C bewaard (gedurende maximaal 96u). |
| Acceptatiecriteria staalontvangst | Correct en onbeschadigd recipiënt met duidelijke identificatiegegevens. |
| Acceptatiecriteria bijaanvraag | Indien het monster een correcte pre-analytische fase doorliep en veilig bewaard zit (zie bewaarcondities), is dit toegelaten. |
| Transport voorwaarden | Respiratoire monsters dienen zo snel mogelijk naar het labo getransporteerd te worden; zoniet moet men ze bewaren bij 4°C tot transport (gedurende maximum 96 uur). Indien bewaring voor transport langer duurt, graag bij -80°C. |
| Analyse frequentie | Minimaal 2x/week; in het respiratoir seizoen dagelijks |
| Antwoordtijd | 24 uur tot 5 dagen |
| 24/24uur | Neen |
| Antwoordtijd indien dringend | 24 uur |
| Verantwoordelijk klinisch bioloog | Dr. Marijke Reynders |
| Uitvoerende laboratoriumdienst/afdeling | Dienst Laboratoriumgeneeskunde; Operationele Eenheid Moleculaire Biologie; Werkpost Moleculaire Biologie - Microbiologie |
| Techniek/methode | De test is gebaseerd op 3 processen: (i) DNA/RNA bereiding via de geautomatiseerde QS extractie (Qiagen). Tijdens iedere extractie wordt PDV toegevoegd aan het te extraheren monster en dit fungeert als extractie- en amplificatie controle. (ii) Mengen van het extract met de Mastermix en laden van de arraykaart (iii) Simultane PCR amplificatie en detectie van het doelwit DNA en het interne controle DNA gebruik makend van specifieke primers en probes. De doelwitsequenties wordt opgespoord in 48 verschillende uniplex real-time PCR reacties, en aparte reactie is voorzien om PDV als interne controle op te sporen, 18S rRNA en RNAseP als controle op de aanwezigheid van humane cellen. |
| Toestel | Viia 7 (life technologies) |
| Eenheid of kwalitatief | Kwalitatief |
| Referentie waarden | Geen detectie van viraal RNA |
| Interpretatie | Humane rhinovirussen (binnen de familie picornavirussen; > 150 serotypes beschreven) zijn gekend als meest frequente oorzaak van acute bovenste luchtweginfectie, zoals common cold, in kinderen en volwassenen. Daarentegen werden ze traditioneel niet geassocieerd aan lage luchtweginfectie of significante morbiditeit. Met de ontwikkeling van moleculaire assays om respiratoire virussen te detecteren, worden rhinovirussen in toenemende mate teruggevonden in gehospitaliseerde kinderen en volwassenen met ernstige lage luchtweginfectie. Intussen is er actueel een forse groei in literatuurdata die ondersteunen dat rhinovirussen oorzakelijke agentia kunnen zijn van asthma exacerbatie, bronchiolitis, en virale pneumonie, frequente hospitalisatieredenen kunnen zijn van kinderen en volwassenen. Hayden reviewed de evidentie dat rhinovirussen vlot kunnen repliceren thv lage luchtweginfectie. Hohenthal et al vond in een studie van 231 gevallen van CAP, 5 gevallen waar enterovirussen de enige aangetoonde agentia waren en 2 gevallen waar rhinovirussen als enige agentia werden geïdentificeerd. Ghosh beschreef 4 volwassen patiënten met significante beenmergsuppressie volgend op bloed- en beenmerg transplantatie die rhinovirusinfectie opliepen met fatale pneumonie tot gevolg. Geen andere pathogenen buiten rhinovirussen konden in het licht gesteld worden bij deze 4 individuen en bij autopsie werd telkens een beeld van interstitiële pneumonitis gevonden. |
| Deelname EKE | QCMD |
| Accreditatie | Nee |
| Aanvraagformulier | AFAZFAB00004 Laboratoriumtesten voor microbiologie |
| B-waarde | 50 euro ten laste van patiënt per respiratoire micro-array test |
| Versiedatum | 13/12/2022 |
