Basic data
| Activiteitencentrum | Sint-Jan |
| Database | Moleculaire microbiologie |
| Groep | Fungale DNA detectie |
| Code | 55092 |
| Verzending | Nee |
Detail data
| Lichaamsmateriaal voorkeur | BAL |
| Lichaamsmateriaal toegelaten | Nasopharyngeaal aspiraat, tracheobronchiaal aspiraat |
| Recipient voorkeur | Steriele tube of potje met schroefdop |
| Mininum vereiste volume | 1 mL |
| Analysevolume | 800 µL |
| Speciale afname condities | 24 uur bij kamertemperatuur, bijkomend 72 uur bij 2-8°C , langer bij < -18°C. Igv BAL: idealiter BAL-GM in parallel aanvragen, gezien beide testen niet op hetzelfde moment positiveren igv een invasieve pulmonaire Aspergillose. |
| Acceptatiecriteria staalontvangst | Correct en onbeschadigd recipiënt met duidelijke identificatiegegevens. |
| Acceptatiecriteria bijaanvraag | Indien het monster een correcte pre-analytische fase doorliep en veilig bewaard zit (zie bewaarcondities), is dit toegelaten. |
| Antwoordtijd | 24 uur tot maximaal 5 dagen |
| 24/24uur | Neen |
| Antwoordtijd indien dringend | 24 uur |
| Verantwoordelijk klinisch bioloog | dr. Marijke Reynders |
| Uitvoerende laboratoriumdienst/afdeling | Dienst Laboratoriumgeneeskunde; Operationele Eenheid Moleculaire Biologie; werkpost Moleculaire Biologie-Microbiologie |
| Techniek/methode | (i) DNA/RNA bereiding via de geautomatiseerde QS extractie (Qiagen). Tijdens iedere extractie wordt PDV toegevoegd aan het te extraheren monster en dit fungeert als extractie- en amplificatie controle. (ii) Mengen van het extract met de Mastermix en laden van de arraykaart (iii) simultane PCR amplificatie en detectie van het doelwit DNA en het interne controle DNA gebruik makend van specifieke primers en probes. De doelwitsequenties wordt opgespoord in 48 verschillende uniplex real-time PCR reacties, en aparte reactie is voorzien om PDV als interne controle op te sporen, 18SrRNA en RNAseP als controle op de aanwezigheid van humane cellen. |
| Toestel | Viia7 (lifetech) |
| Interpretatie | Semi-kwantitatief: BAL ct <=35: Positief: Aspergillair DNA duidelijk aantoonbaar. Te toetsen aan galactomannan test, schimmelkweek en rechtstreeks onderzoek op BAL, kliniek (COPD, ICU, hemato,...), beeldvorming en eventuele risicofactoren op invasieve pulmonaire Aspergillose; een uitgesproken kolonisatie is echter niet uitgesloten. ct >35 en < 40: Zwak positief: Zwak signaal, mogelijk van beperkt klinisch belang. Het kan hier gaan om dragerschap of contaminatie uit de omgeving; maar anderzijds tevens om een vroege fase van invasieve pulmonaire aspergillose in risicopopulaties (hemato-onco, ICU, post-influenza infectie, HD corticosteroïden, therapie met "biologicals", COPD,...). Te toetsen aan Ag GM resultaat in BAL (en serum waar geïndiceerd), kliniek, beeldvorming, risicofactoren en eventuaal andere aanvullende onderzoeken. Ct >= 40: Niet detecteerbaar |
| Aanvraagformulier | AFAZFAB00004 Laboratoriumtesten voor microbiologie & AFAZFAB00007 Infectieuze serologie, moleculaire microbiologie en antivirale middelen |
| B-waarde | 50 euro voor externe patiënten (kost respiratoire micro-array) |
| Versiedatum | 13/12/2022 |
