Basic data
| Activiteitencentrum | Sint-Jan |
| Database | Moleculaire microbiologie |
| Groep | Bacteriële DNA detectie |
| Code | 55092 |
| Verzending | Nee |
Detail data
| Lichaamsmateriaal voorkeur | BAL |
| Lichaamsmateriaal toegelaten | andere diep pulmonaire vochten; rhinopharyngeale aspiraten |
| Recipient voorkeur | Steriel recipient hermetisch afsluitbaar |
| Mininum vereiste volume | 1 mL |
| Analysevolume | 800 µL |
| Speciale afname condities | Indien ook een gewone bacteriële kweek moet uitgevoerd worden, moet het monster aan de eisen van de bacteriële kweek voldoen. |
| Bewaarcondities en voorbehandeling | 24 uur bij kamertemperatuur, bijkomend 24 uur bij 2-8°C, langer bij < -18°C |
| Acceptatiecriteria staalontvangst | Correct en onbeschadigd recipiënt met duidelijke identificatiegegevens. |
| Acceptatiecriteria bijaanvraag | Indien het monster een correcte pre-analytische fase doorliep en veilig bewaard zit (zie bewaarcondities), is dit toegelaten. |
| Transport voorwaarden | Transport binnen de 24 uur na afname bij 2-30°C, indien het transport langer duurt het monster bewaren bij 2-8°C. |
| Analyse frequentie | Micro-array: Minimaal 3x/week; in het respiratoir seizoen dagelijks |
| Antwoordtijd | 24 u tot maximaal 72u |
| 24/24uur | Neen |
| Antwoordtijd indien dringend | 24 uur (na tel microbioloog) |
| Verantwoordelijk klinisch bioloog | dr. Marijke Reynders |
| Uitvoerende laboratoriumdienst/afdeling | Dienst Laboratoriumgeneeskunde; Operationele Eenheid Moleculaire Biologie; werkpost Moleculaire Biologie-Microbiologie |
| Techniek/methode | Micro-array respiratoire pathogenen:(i) DNA/RNA bereiding via de geautomatiseerde QS extractie (Qiagen). Tijdens iedere extractie wordt PDV toegevoegd aan het te extraheren monster en dit fungeert als extractie- en amplificatie controle. (ii) Mengen van het extract met de Mastermix en laden van de arraykaart (iii) simultane PCR amplificatie en detectie van het doelwit DNA en het interne controle DNA gebruik makend van specifieke primers en probes. De doelwitsequenties wordt opgespoord in 48 verschillende uniplex real-time PCR reacties, en aparte reactie is voorzien om PDV als interne controle op te sporen, 18SrRNA en RNAseP als controle op de aanwezigheid van humane cellen. |
| Toestel | Viia7 |
| Eenheid of kwalitatief | Kwalitatief |
| Referentie waarden | Afwezigheid van bacterieel DNA |
| Interpretatie | Chlamydia psittaci is een bacterie die overgedragen wordt van vogels (vaak vogels die als huisdier gehouden worden) op mensen. Geïnfecteerde vogels scheiden de bacterie uit in stoelgang en nasale secreten, deze vochten kunnen maanden infectieus blijven. In de mens zal de infectie, psittacose (of ornithose of papegaaienziekte) genoemd, resulteren in influenza-like symptomen in de meeste patiënten. Soms is er een evolutie naar manifeste pneumonie (interstitiële of lobaire infiltraten zijn beiden mogelijk) met respiratoire distress en tevens zijn ernstige niet-respiratoire problemen beschreven (endocarditis, myocarditis, hepatitis, arthritis, keratoconjunctivitis, en encephalitis). In zwangeren kent de infectie mogelijk een meer ernstig verloop met thrombocytopenie en hepatitis, ARDS en foetale dood. Met de juiste antibacteriële therapie is deze ziekte zelden fataal. Diagnostiek met artisanale methoden is ongevoelig en moeilijk.In de acute fase is een diep respiratoir staal aangewezen voor PCR-testing, in de convalescente fase kan men specifieke serologische technieken aanwenden om de infectie aan het licht te brengen. |
| Accreditatie | Nee |
| Aanvraagformulier | AFAZFAB00004 Laboratoriumtesten voor microbiologie |
| B-waarde | 50 euro voor externe patiënten (kost micro-array) |
| Versiedatum | 13/12/2022 |
