| Lichaamsmateriaal voorkeur |
Isolaat |
| Lichaamsmateriaal toegelaten |
Normaal steriele afnameplaats, kweek-negatieve biopten/edele vochten |
| Recipient voorkeur |
Petriplaat, "steriel" weefsel |
| Recipient toegelaten |
Steriel recipient hermetisch afsluitbaar |
| Mininum vereiste volume |
1 ml |
| Speciale afname condities |
Vers isolaat, kweek-negatief edel monster |
| Bewaarcondities en voorbehandeling |
Koelkast |
| Acceptatiecriteria staalontvangst |
Correct en onbeschadigd recipiënt met duidelijke identificatiegegevens. |
| Acceptatiecriteria bijaanvraag |
Indien het monster een correcte pre-analytische fase doorliep en veilig bewaard zit (zie bewaarcondities), is dit toegelaten. |
| Transport voorwaarden |
Bij kamertemperatuur |
| Analyse frequentie |
In functie van de aanvragen |
| Antwoordtijd |
14 dagen |
| 24/24uur |
Nee |
| Antwoordtijd indien dringend |
NVT |
| Verantwoordelijk klinisch bioloog |
dr. Marijke Reynders |
| Uitvoerende laboratoriumdienst/afdeling |
Dienst Laboratoriumgeneeskunde; Operationele Eenheid Moleculaire Biologie; Werkpost Moleculaire Biologie - Microbiologie |
| Techniek/methode |
Deze methode is gebaseerd op een PCR-reactie voor het specifiek amplificeren van een 774 bp fragment van het 16S rRNA-gen. Na amplificatie wordt het bekomen fragment gesequeneerd. Wanneer de definitieve sequentie gekend is, kan deze gebruikt worden om te vergelijken t.o.v. een database met sequenties van gekende bacteriën om tot een identificatie te komen. Dit gebeurt door middel van de Basic Local Alignment Search Tool (BLAST). |
| Toestel |
Thermal Cycler ABI9700; 3500xL Genetic Analyzer |
| Eenheid of kwalitatief |
Kwalitatief |
| Interpretatie |
CLSI MM18-A: Interpretative criteria for interpretation of bacteria and fungi by DNA target sequencing, |
| Deelname EKE |
Nee |
| Accreditatie |
Nee |
| Aanvraagformulier |
AFAZFAB00004 Laboratoriumtesten voor Microbiologie |
| B-waarde |
60 € |
| Zoektermen |
16S, 16S rRNA, sequentie |
| Versiedatum |
13/12/2022 |
